- analiza proteomiczna profili białkowych z wykorzystaniem metody elektroforezy dwukierunkowej (2DE);
- analiza białkowych markerów molekularnych w ocenie odporności roślin na suszę;
- analiza molekularna białek przy wykorzystaniu techniki Western Blot;
- określanie prawdopodobnych miejsc karbonylacji w sekwencji białkowej;
- określanie prawdopodobnych interakcji pomiędzy białkami;
- analiza systemu naprawczego białek;
- ocena funkcjonowania systemu antyoksydacyjnego w komórkach roślinnych w warunkach kontrolnych oraz poddanych stresowi odwodnienia;
Osoba do kontaktu: dr inż. Małgorzata Nykiel
Publikacje z tego zakresu:
- Gietler M., Nykiel M., Orzechowski S., Fettke J., Zagdańska B.2017 Protein carbonylation linked to wheat seedling tolerance to water deficiency. Environ Exp Bot 137C: 84-95 DOI 10.1016/j.envexpbot.2017.02.004
- Dworak A., Nykiel M. , Walczak B., Miazek A., Szworst-Łupina D., Zagdańska B., Kiełkiewicz M. 2016 Maize proteomic responses to separate or overlapping soil drought and two-spotted spider mite stresses Planta 244(4): 939-960 DOI: 10.1007/s00425-016-2559-6
- Gietler M., Nykiel M., Orzechowski S., Fettke J., Zagdańska B. 2016 Proteomic analysis of S-nitrosylated and S-glutathionylated proteins in wheat seedlings with different dehydration tolerances. Plant Physiology and Biochemistry 108:507-518 DOI: 10.1016/j.plaphy.2016.08.017
- Gietler M, Nykiel M, Zagdańska B 2016 Changes in the reduction state of ascorbate and glutathione, protein oxidation and hydrolysis leading to the development of dehydration intolerance in Triticum aestivum L. seedlings. Plant Growth Regulation 79: 287–297
- Grudkowska M., Lisik P., Rybka K. 2013 Two-dimensional zymography in detection of proteolytic enzymes in wheat leaves. Acta Physiol Plant 35:3477-3482 DOI: 10.1007/s11738-013-1371-1
Wykaz aparatury badawczej, jaką dysponuje Katedra:
- zestaw do izoelektroogniskowania – aparat Protean IEF Cell (Biorad);
- zestaw do elektroforezy pionowej – aparat Mini Protean Tetra oraz Protean II xi Cell (Biorad);
- wolnostojące komory fitotronowe z możliwością regulacji temperatury, fotoperiodu i natężenia światła.
Wykaz jednostek gospodarczych/naukowych (krajowych i zagranicznych), z którymi prowadziliśmy do tej pory podobną współpracę:
- Instytut Hodowli i Aklimatyzacji Roślin oddział w Radzikowie, Jadwisinie i Młochowie
- Centrum Spektometrii Mas Biopolimerów Uniwersytetu w Poczdamie (Republika Federalna Niemiec)
Wykaz projektów o podobnej tematyce
- 2010-2013 ,,Odporność czy starzenie? Charakterystyka proteinaz cysteinowych aktywowanych suszą glebową’’. Nr N N310 079839; kierownik; Wniosek badawczy własny finansowany przez MNiSW; Małgorzata Nykiel- kierownik
- 2016 „Rola proteasomu 20S oraz proteolizy wakuolarnej w usuwaniu białek nieprawidłowych indukowanych deficytem wody”, Grantu wewnętrzny SGGW nr 505-10-011300-N00229-99; Marta Gietler- kierownik
- 2015 „Analiza zmian profili proteomicznych białek ulegających wybranym modyfikacjom oksydoredukcyjnym na skutek dehydratacji”, Grant wewnętrzny SGGW nr 505-10-011300-M00228-99; Marta Gietler- kierownik
- 2014 „S-nitrozylacja i S-glutationylacja białek w siewkach pszenicy (Triticum aestivum L.) poddanych działaniu suszy”, Grant wewnętrzny SGGW nr 505-10-011300-L00307-99; Marta Gietler- kierownik
- 2013 „Analiza proteomiczna siewek pszenicy (Triticum aestivum L.) poddanych działaniu suszy”, Grant wewnętrzny SGGW nr 505-10-011300-K00381-99; Marta Gietler- kierownik